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多聚核糖體分析(Polysome Profiling)

更新時間:2025-04-14   點擊次數(shù):748次

技術簡介

基因表達在多個層面上受到調控,包括:表觀遺傳水平調控、轉錄水平調控、翻譯水平調控以及翻譯后修飾調控。其中,翻譯調控控制著蛋白質的生物合成以響應生理和病理的變化。而且,翻譯水平的調控也深刻影響了蛋白質的豐度。研究翻譯水平的調控機制,有助于深入理解基因表達調控機制,并且可以解釋轉錄組和蛋白質組分析之間的差異。

多聚核糖體分析(Polysome profiling)是研究翻譯調控機制常用的技術。Polysome profiling通過蔗糖密度梯度超速離心分離free mRNA、40S和60S核糖體亞基、單核糖體和多聚核糖體,收集含有多聚核糖體的部分用于RNA或蛋白質分析。也可以通過酶消化檢測disome。

Polysome profiling既可用于特定mRNA的靶向分析,也可用于整體分析。相對于Ribo-seq來說還可以獲得全長翻譯的mRNA,包括非翻譯區(qū)(UTRs),而UTRs含有調節(jié)選擇性翻譯的順式作用元件。鑒定與翻譯的mRNA亞型相對應的UTRs和保守的順式作用元件對于基因表達調控的機制分析至關重要。此外,多聚體分析可以與免疫印跡或蛋白質組學相結合,來監(jiān)測與核糖體或起始復合物相關的蛋白質。最后,多聚體圖譜分析特別適用于缺少基因組數(shù)據(jù)或不可能進行基因操作的模式生物。

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