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介紹酵母雙雜交的兩種構(gòu)建方法

更新時間:2021-07-27   點擊次數(shù):3483次
  酵母雙雜交技術作為研究蛋白質(zhì)相互作用的主要方法,在規(guī)?;鞍踪|(zhì)相互作用研究中占據(jù)舉足輕重的地位,已經(jīng)成為分子生物學研究領域的重要實驗手段,因此有不少生物公司提供從構(gòu)建雜交文庫到文庫篩選的一站式酵母雙雜交服務。但是酵母雙雜交技術的分子生物學操作是比較復雜的,包含從基因的載體構(gòu)建、蛋白質(zhì)的自激活檢測到多次酵母轉(zhuǎn)化和相互作用的確認,對酵母雙雜交技術進行改進,可以提高其工作效率。
  目前市場上提供的酵母雙雜交服務有核體系和膜體系兩種,酵母雙雜交與其他相互作用篩選手段相比,最大的優(yōu)勢在于它能夠適應基因組水平的高通量篩選。美迪西提供酵母雙雜交服務,其具有獨立優(yōu)質(zhì)的實驗室和專業(yè)的實驗人員,提供詳細的酵母雙雜交實驗步驟、原始數(shù)據(jù)和圖片、結(jié)果分析,可以出具檢測數(shù)據(jù)報告。
  為了降低工作量使其更適用于高通量篩選,需要對酵母雙雜交技術進行改進,常采用的手段有酵母雙雜交陣列篩選技術和規(guī)模化載體構(gòu)建方法。
  1、酵母雙雜交陣列篩選技術
  從傳統(tǒng)的酵母雙雜交技術基礎上發(fā)展而來的酵母雙雜交文庫篩選技術能夠支持一個誘餌與整個cDNA文庫的篩選,可以用于篩選一個蛋白質(zhì)與整個cDNA文庫中的相互作用。但是該技術并不適用于基因組水平的相互作用篩選。
  首先,基因組水平的相互作用篩選需要成千上萬的誘餌,而對這些誘餌進行文庫篩選工作量極大;其次,由于cDNA片段不同,篩選過程中呈劣勢生長的菌株不容易得到篩選;最后篩庫同樣面臨單次篩選只能獲得文庫中極少部分的相互作用結(jié)果。為了適應基因組水平的相互作用篩選,人們開發(fā)了酵母雙雜交陣列篩選技術。
  陣列篩選法又可分為一對一陣列、高通量陣列法、亞庫對亞庫法。一對一陣列法含有不同BD-X的菌株和所有含不同AD-Y的菌株一一對應篩選。
  高通量陣列法是把所有不同ORF-AD集合成庫,然后與排成陣列的不同BD-X作用的篩選方法,其實質(zhì)是誘餌數(shù)量較大情況下的陣列化文庫篩選。亞庫對亞庫法把總數(shù)較大的DBD-X和AD-Y的成員分別編號并分組,每組含一定數(shù)量的成員,然后集合每組成員形成亞庫(pool),再用獵物亞庫對誘餌亞庫一一作用,篩選陽性克隆。此法工作量大,獲得的陽性克隆的獵物和誘餌都需測序鑒定。
  2、規(guī)?;d體構(gòu)建方法
  規(guī)?;湍鸽p雜交篩選需要構(gòu)建大量的表達載體,因此載體構(gòu)建工作的質(zhì)量和速度對于后續(xù)的酵母雙雜交篩選至關重要。傳統(tǒng)的構(gòu)建載體的方法是限制酶切-連接方法,可以有效地將目的片段插入載體,然而其操作時間長,需要酶切、連接兩步反應,構(gòu)建成功后的重組質(zhì)粒需要進行DNA測序來驗證其正確性,表達載體的構(gòu)建過程中存在載體自連、連接困難等缺點,這些缺點使得限制酶切-連接方法不能用于高通量的載體構(gòu)建。

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